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小貝戰(zhàn)“疫”:當(dāng)抗病毒藥物篩選遇上自動化工作站
近日,我國研究人員評估了幾種廣譜抗病毒藥物對新型冠狀病毒SARS-Cov-2的抑制作用。1細(xì)胞實驗發(fā)現(xiàn),瑞德西韋和鹽酸氯喹的半數(shù)有效濃度EC50分別為0.77 uM和1.13 uM,選擇系數(shù)SI分別大于129和88。這表明它們在細(xì)胞水平能夠有效抑制SARS-Cov-2的感染。
事實上一個抗病毒藥物絕非朝夕煉成,需要經(jīng)歷體外實驗、體內(nèi)動物實驗、臨床試驗的一系列研究歷程,周期長、投入大、風(fēng)險高。體外實驗處于藥物發(fā)現(xiàn)的早期,是非常重要的基石步驟。通過細(xì)胞模型對化合物的細(xì)胞毒性和病毒抑制能力進(jìn)行篩選,能夠定量地評價其有效性,也可以排除不必要的藥物化學(xué)結(jié)構(gòu)設(shè)計、篩選,或者后續(xù)體內(nèi)實驗的前期投入。
類似于對瑞德西韋和鹽酸氯喹的實驗,測試現(xiàn)有的抗病毒藥物對新型冠狀病毒的藥效,是對新型冠狀病毒這樣突發(fā)疫情的一條高效路徑。同時,開展對大量先導(dǎo)化合物庫的高通量篩選,也將是發(fā)展抗新型冠狀病毒藥物的重點工作。
隨著篩選通量和復(fù)雜程度的增加,自動化工作站已逐漸成為藥物篩選的重要手段。Biomek自動化工作站可以有效地管理實驗流,處理多類型、多進(jìn)程的高通量實驗。與傳統(tǒng)的人工實驗相比,Biomek工作站能夠有效節(jié)省人力,標(biāo)準(zhǔn)化工作流,縮短研發(fā)周期,提高研發(fā)效率。
【自動化的抗病毒藥物篩選方案】
絕不僅僅是移液
無菌、振蕩、溫控、儲存、孵育,全都可以有
讀板檢測、在線離心、細(xì)胞計數(shù)、大體積分液,也都可以有
我們還有
· 開放的儀器設(shè)計,輕松實現(xiàn)拓展整合
· 軟件工具支持?jǐn)?shù)據(jù)的采集、保存與溯源
· 工作流的時序優(yōu)化,實現(xiàn)多進(jìn)程、無人值守實驗
· 紅外光幕自動感應(yīng)防護(hù),內(nèi)置攝像頭捕捉出錯瞬間
(此處插入短視頻)
小貝的藥篩方案可輔助完成:
· 高通量先導(dǎo)化合物初篩
· 化合物次級篩選
· 藥物靶點量效關(guān)系
· 細(xì)胞實驗
· 細(xì)胞培養(yǎng)
· 化合物庫管理
參考Biomek自動化工作站已經(jīng)應(yīng)用到抗菌化合物2,SARS冠狀病毒抑制物3,甲型流感病毒H3N2抑制物4等藥物篩選。自動化實驗和手工實驗的IC50值高度一致。
1. Wang M., Cao R., Zhang L. et al. Remdesivir and chloroquine effectively inhibit the recently emerged novel coronavirus (2019-nCoV) in vitro. Cell Res (2020). https://doi.org/10.1038/s41422-020-0282-0
2. Forry S. P., Madonna M. C., López?Pérez D. et al. Automation of antimicrobial activity screening. AMB Expr (2016) 6:20. DOI: 10.1186/s13568-016-0191-2
3. Severson W. E., Shindo N., Sosa M. et al. Development and Validation of a High-Throughput Screen for Inhibitors of SARS CoV and Its Application in Screening of a 100,000-Compound Library. Journal of Biomolecular Screening 12(1); 2007. DOI: 10.1177/1087057106296688
4. Severson W. E., Mcdowell M., Ananthan S. et al. High-Throughput Screening of a 100,000-Compound Library for Inhibitors of Influenza A Virus (H3N2). Journal of Biomolecular Screening 13(9); 2008 DOI: 10.1177/1087057108323123
*本文涉及的內(nèi)容與產(chǎn)品僅用于科研和工業(yè),不用于臨床診斷。